歷史回顧　　1419年，經教宗馬丁五世2月13日簽署的教諭許可，梅克倫堡公爵約翰三世和阿爾布萊希特五世與漢薩城市德國羅斯托克大學[1]羅斯托克的市議會共同創建了羅斯托克大學，開幕慶典於11月12日在聖瑪麗亞教堂舉行。大學最初由法學院，醫學院和藝術學院（約1580年改稱為哲學院）組成，而神學院的建立因異端思潮影響直到1432年才被教宗尤金四世允諾。
　　十五世紀，有400至500名學生在羅斯托克大學學習，主要來自荷蘭、斯堪的納維亞和波羅的海沿岸地區。羅斯托克大學據此在當時的德國屬於大規模大學之列。由於政局混亂，羅斯托克大學於1437年在教會的壓力下，服從巴塞爾宗教會議的禁令遷往格賴夫斯瓦爾德。此禁令於1440年撤銷，而大學直到1443年才遷回羅斯托克，1487年至1488年（一說至1492年）大學又曾遷往漢薩城市呂貝克。
　　十六世紀，人文主義和路德學說傳入羅斯托克大學。隨羅斯托克市之後,大學於1542年接受新教。
　　十七世紀，約阿希姆・詠鳩斯於1622年在羅斯托克大學創辦了德國第一所自然科學研究學會。而後的三十年戰爭使奉行路德新教的羅斯托克大學一度走入低潮，變為一個地方青年的高校。獵女巫時期林特爾恩大學、羅斯托克大學和維滕貝格大學是最重要的鑑定大學，當時各德國大學法學院的裁判方法非常不同，赫爾姆施泰特大學和林特爾恩大學的法學院被認為是強硬派。
　　十八世紀，梅克倫堡-什未林公爵虔誠者弗里德里希因教義分歧干涉羅斯托克大學事務, 於1760年同擁護公爵的教授在比措籌建新校, 此校於1789年由公爵弗里德里希・弗蘭茨一世授意迴歸羅斯托克大學。
　　十九世紀，梅克倫堡的兩個公國於1815年均升格為大公國，羅斯托克大學的所有權於1827年歸屬梅克倫堡-什未林大公。此後羅斯托克大學得以擴建，1870年建成了梅克倫堡式文藝復興風格的新主樓，1899年開辦了德國第一所大學附屬耳鼻喉科醫院。
　　二十世紀，羅斯托克大學於1919年建校五百週年之際授予阿爾伯特・愛因斯坦和馬克斯・普朗克榮譽博士學位。納粹時期大學在校生人數銳減，與此前1930年的1700人對比, 1939年在校生僅有700餘人。愛因斯坦在羅斯托克大學的榮譽博士學位，也是他的第一項此類榮譽，在這一時期並未撤銷，其原因未知。二戰期間大學暫時關閉，1946年2月24日重新開放。適應當時局勢需要，大學曾設置一所開辦至1963年的以培養青年精英為目的的恩斯特・臺爾曼工農學院。1950年農業學院成立，1951年造船系成立，1963年造船系改稱技術學院，這也是德國古典大學首次設置工科院系，同年亦增設了工程經濟系。1976年大學更名為威廉・皮克大學，直至1990年德國統一恢復原名，此後羅斯托克大學進行了新的院系調整。現今概況　　目前羅斯托克大學設有九個學院，五十個專業，教職員工約4600人，在校生約15000人。
　　羅斯托克大學圖書館建於1569年，包括三個區域圖書館、十個專業圖書館以及大學檔案館、保管室、專利和標準中心，藏書約220萬冊，亦藏有眾多古籍，包括2800卷手抄本和簽名、650卷古版書和14份遺產。
　　南城食堂是羅斯托克大學的主要食堂，位於阿爾伯特・愛因斯坦街，於1999年新建，在2003年學生雜誌《UNICUM》的一次評比中排名德國大學食堂第二位。現已拆除的舊食堂在學生參與下建於1976年，設有曾頗受歡迎的食堂電影娛樂部和牛奶吧，這兩項設施在新建築中被省略，2004年5月在舊食堂原址（即新食堂和南環路之間）建成了第一圖書館的新館。另一食堂位於聖喬治街，靠近市中心。
　　從1992年開始羅斯托克大學也開始提供深化函授專業。這些專業和博洛尼亞過程範圍內的質量保障中心的改組屬於同一計劃。
　　羅斯托克大學的語言中心為各專業學生提供很多可獲得國際UNIcert證書的語言課程。
　　現任校長漢斯・于爾根・溫德爾教授於2002年當選。2006年5月17日由教授、職員和學生各22人組成的大學議會選出新任校長托馬斯・施特羅特霍特。校長任期四年。學院列表　　(以德語名稱字母排列為序)
　　* 農業和環境科學學院
　　* 計算機科學和電子技術學院
　　* 機械製造和船舶技術學院
　　* 法學院
　　* 數學和自然科學學院
　　* 醫學院
　　* 哲學院
　　* 神學院
　　* 經濟和社會科學學院專業設置　　農業生態學，土木工程學，企業管理學，生物學，英國文學語文化，商務訊息，化學，德語語言文學，電工學，教育學，日爾曼文學，歷史，古代學，訊息學，訊息技術/技術訊息學，區域文化與環境保護，機械製造，數學，醫學，音樂學，哲學，物理學，政治學，法學，船舶技術，特殊教育，體育學，技術數學，神學，國民經濟學，經濟訊息學，經濟數學，經濟工程學經濟教育學。知名人士　　* 第谷・布拉赫，天文學家，占星學家，煉金術士，曾在此求學
　　* 樂維努斯・巴圖斯，醫學家，講師
　　* 魯道夫・柏林，醫學家，眼科教授，院長，校長
　　* 瓦爾特・哈爾施泰因，政治家，法學家，民法和公司法教授
　　* 庫爾特・馮・弗裡茨，古典語文學家，古希臘語文教授
　　* 約阿希姆・詠鳩斯，數學家，物理學家，哲學家，數學教授
　　* 瓦爾特・科姆博夫斯基，作家，近代文學文化史榮譽教授
　　* 海因裡希・弗里德里希・林克，自然科學家，化學、動物學和植物學教授
　　* 莫里茨・施利克，哲學家，哲學教授
　　* 海因裡希・施裡曼，考古學家，在此獲博士學位
　　* 魯道夫・施泰納，人類智慧學創立者，在此獲博士學位
　　* 奧托・施特納，物理學家，實驗物理教授
　　* 烏爾裡希・馮・扈騰，人文主義者，在此發表首篇著作
　　* 薩穆埃爾・哥特里普・弗格爾，醫生，醫學教授
　　* 奧古斯特・齊爾默，精算學家，在此獲博士學位國內新聞　　2010年05月14日下午，合肥市長吳存榮在市政務中心會見了德國羅斯托克市市長羅蘭德・麥特林一行。雙方簽署了友好交流合作協議書，將在多領域開展多種形式的交流與合作，促進共同繁榮發展。吳存榮在會見中說，德國與合肥雖然相距萬里，但是兩地交往頻繁，不僅是經濟上，在文化、教育等各方面都有著密切的合作。合肥學院與羅斯托克大學的交流合作也是源遠流長，在增進兩市友誼方面起到了很好的作用。